“黑壳病”的治疗，应当从促进“黑壳虾”尽快蜕壳，加强虾池的水体消毒和底质改良着手。具体方法是：
1、首先要对“黑壳虾”进行显微镜检查，看有没有纤毛虫寄生。若纤毛虫达到了一定数量，要先用“纤虫必杀”或“虾蟹虫绝”和水全池泼洒，杀灭寄生在虾体上的纤毛虫。一般每次外用“纤虫必杀”400g/667平方米?m，或外用“虾蟹虫绝”200～250g/667平方米?m，具体的用药量要随天气的变化、水温的高低等灵活掌握，特别是高温时节，“纤虫必杀”或“虾蟹虫绝”的用量一定要大幅减量。杀虫药要尽量选择在晴天使用，由于发生“黑壳病”的虾池水质较为浓浊，一般用药后的当日夜晚或次日夜晚虾池有可能出现一定程度的虾浮头现象，因此用药后要注意观察，一旦发现异常，要及时加注新水、开增氧机，以免造成损失。在杀虫药使用48h后，需换水0.3m(换水时一定要先排后进，一边排水一边注水效果较差)，以及时消除杀虫剂的毒副作用，同时大幅度降低虾池中有机质含量及各种悬浮物颗粒的含量，排出过多而老化的浮游生物。杀灭寄生在虾体上的纤毛虫，并及时更换新水，能促进“黑壳虾”的顺利蜕壳。
2、使用杀虫剂并套换部分池水后，接着外用“菌毒绝杀”和水全池泼洒消毒。“菌毒绝杀”的用量一般每次用200～250g/667平方米?m，具体的用药量要随天气的变化、水温的高低等灵活掌握，用药48h后换水0.3m左右。接着再外用“菌毒绝杀”一次，隔48h后再换水0.3m(换水可消除“菌毒绝杀”的毒副作用，大幅度降低虾池中有机质含量及各种悬浮颗粒的含量，排出过多而老化的浮游生物)。“菌毒绝杀”是含氯类稳定的强氧化剂，具有杀菌力强、作用持久的特点，并能大幅度地氧化降解池水中及池底部亚硝酸盐、硫化氢等有害物质的含量，因而能使“黑壳虾”体壳黑色变淡，并能使得“黑壳虾”蜕壳后不再重新变黑。根据笔者的门诊实践，一般外用1次“纤虫必杀”或“虾蟹虫绝”，连用2次“菌毒绝杀”后，结合虾池用药后的换水处理，“黑壳虾”即能顺利蜕壳且不再重新变黑。再看此时的虾池水，已由原先的浓浊老化变得肥嫩而十分清爽，透明度大大提高，表层的蓝绿藻“水花”及浮膜已不复存在，真正达到了“肥而爽”的水质要求。对于没有纤毛虫寄生的虾池，可直接连用2次“菌毒绝杀”并结合虾池的换水处理，能达到同样的治疗效果。一般7、8月份高温季节，治愈“黑壳虾”需时7d左右;9月份以后随着水温渐低，一般需时10d左右。只用药不换水的虾池，用药效果相对要差很多。