圈舍中常见的有害气体主要有氨气、硫化氢、一氧化碳、二氧化碳等。氨气会刺激畜禽，导致打喷嚏，流涎，丧失食欲，易发呼吸道疾病;硫化氢、一氧化碳、二氧化碳的浓度过高，常常会导致食欲减退，抵抗力下降，严重时还会因中毒而死亡。
要保持畜禽舍内空气清新，最好的办法是开窗通风，及时排除舍内污浊的空气，即使在冬季，也不要长期封闭门窗。但在冬季要注意：排除过多的水汽，使舍内空气的相对湿度保持适宜状态;维持适中的气温，不致发生剧烈变化;气流稳定，不要形成贼风，要求整个圈舍内气流均匀，无死角;清除空气中的微生物、灰尘以及圈舍内的有害气体和恶臭气味;防止水汽在墙壁、天棚、用具上凝结。