我们都知道折耳猫的繁殖是非常严格的，因为自身带有先天性遗传病。所以折耳猫在交配是须特别谨慎。
折耳猫耳朵折的原因是基因突变。而它的四肢、尾部和关节畸形，则与折耳显性基因的出现如影随形。即，两只显性折耳猫交配所生下的小猫，往往会存在先天性的骨骼缺陷，如尾巴僵硬、四肢无力或关节畸形。还有些小猫表面上看不出任何问题，但是到6个月后却停止发育，演变成先天性佝偻症，最后全身衰竭死亡。
为了避免这些悲剧的发生，纯种猫的繁育者们经过几十年的经验积累确立了折耳猫的繁育规则,两只显性基因的苏格兰折耳猫绝不允许交配繁育，而是采取折耳猫与英国短毛猫或美国短毛猫进行繁殖的方式来获得后代。
我们都知道“近亲结婚”遗传病的发病率会很高，而且一般来说折耳猫和折耳猫是不能交配的，更何况同一只猫所生的小猫呢。