在青虾的苗种阶段，特别是变态时期的幼体阶段，较常见的是寄生性疾病，如累枝虫、聚缩虫等在虾体上寄生，影响青虾的蜕壳变态、严重时会因此死亡，降低苗种培育成活率。防止该病的发生主要在于水质的调控，经常保持水质清爽，并具有一定的肥度，防止水体老化。
在抱卵虾的培育阶段，主要是防止敌害生物的侵袭，如水老鼠、蛇类等吞食亲虾，必要时网箱上可使用盖网。注意在网箱中投足饲料，防止缺饲引起青虾自相残杀、残食同类腹部的卵粒和游泳足，导致亲虾死亡。
黑斑病
(1)症状。发病初期，青虾的病灶呈较小的褐斑，以后逐渐溃烂，最后变成黑色。通常在鳃部和腹部，包括步足和游泳足，均带黑色或黑斑。病虾活力大减，或卧于池边处于濒死状态。
(2)病因。主要因青虾养殖池底部形成严重的还原层，使一些分解甲壳和腐屑的细菌大量繁殖而引起。
(3)防治方法。
①保持水质良好，必要时施生石灰或水质改良剂。
②平时小心操作，防止青虾甲壳损伤，并注意放养密度，合理投喂饲料。
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